Häufig entstehen schwarze Verfärbungen von Organen oder einzelnen Strukturen durch Pigmentablagerungen. Von schwarzer Farbe ist zum Beispiel Melanin. Die schwarze Farbe dieser herdförmigen Veränderungen auf einem Leberschnitt beruht auf Melaninreichtum. Es handelt sich um Metastasen eines malignen Melanoms.