Die Therapie erfolgt mit Zytostatika und Steroiden. Ueber die Prognose entscheidet hauptsächlich die Niere: Ist sie noch nicht befallen, ist eine Heilung sehr wahrscheinlich. Ist die Niere betroffen, können nur noch Langzeit-Remissionen erreicht werden. Langzeit-Remissionen aber wenigstens in 90 % der Fälle. Noch eine Bemerkung zur Nomenklatur: Die Wegener Granulomatose und das Midline-Granuloma wurden früher unter dem Oberbegriff "maligne Granulome" zusammengefasst. Da die Wegener Granulomatose seit einigen Jahren teilweise heilbar ist, hat dieser Oberbegriff seinen Sinn verloren.