Eine Infektion mit Pseudomonas aeruginosa löst sowohl beim Bakterium wie auch beim Wirt spezifische Reaktionen aus. Die bakteriellen Reaktionen bestehen einerseits in der Bildung von Exotoxinen und Proteasen. Exotoxine und Proteasen schädigen das Lungengewebe und schwächen die körpereigene Immunabwehr. Andererseits kommt es zu einer mukoiden Transformation der Bakterien .