Auch während beschwerdearmen Phasen mit relativem Wohlbefindens zeigen die CF-Patienten in der Regel einen chronisch Husten mit Auswurf. Typische Zeichen einer akuten Lungeninfektion, auch bei Abwesenheit von Fieber sind: Zunahme von Husten und Auswurf, Verfärbung des Auswurfs, Nachlassen des Appetits, häufig mit Gewichtsverlust rasche Ermüdbarkeit bei Anstrengung oder sogar Atemnot.